가까운 미래의 도쿄에서 초대형 기업 메시아 제약은 새로운 부를 추구하며 생물체를 녹이는 강력한 약물을 비밀리에 개발하고 있다. 배후에서는 정부가 은밀한 수사 부대의 일류 여성 요원 아이에게 이 약물의 실험 캡슐을 탈취하라는 특별 임무를 내린다. 그러나 아이는 이 프로젝트 뒤에 숨겨진 끔찍한 진실을 알게 되고, 캡슐을 숨기기로 결심한다. 한편, 탐욕에 눈이 멀어 악의 길로 빠진 고도로 숙련된 여성 요원 린은 아이를 추적하며 캡슐의 위치를 요구한다. 그녀의 수단은 비밀 심문 매뉴얼인 '퍼플 노트'에 기반한 강도 높은 고문이다. 맹렬한 폭행, 발차기, 매달기, 도구를 이용한 타격, 전기 고문, 특수 로션을 사용한 고통 등 끝없는 학대 속에서 아이는 절망 속에서도 생존을 위해 몸부림친다.