거인 여성을 향한 공격은 예기치 못한 전개를 맞이하며, 주인공은 경고 없이 나타난 두 번째 거인 여성과의 돌발 사건에 휘말리게 된다. 원래의 목표는 무산되었지만, 정부는 거인 여성 중 한 명을 제압한 것을 계기로 성공을 선언한다. 그 대가로, 극비 무기인 '태양 증폭 열선 레이저'가 손상되었고, 그 존재가 우연히도 공개되는 사태가 발생한다. 외국 정부와 국제 언론에의 정보 유출을 막기 위해 즉각 비상 조치가 시행된다. 이 혼란 속에서 압수된 컴퓨터와 휴대 기기의 데이터 내부에서 정체불명의 기이한 영상 한 토막이 발견되고, 이후로부터 지금까지 벌써 2년의 시간이 흘렀다.